Sektor zdravstva vrši upravne i stručne poslove utvrđene Ustavom, zakonom i drugim propisima, koji se odnose na ostvarivanje nadležnosti HNŽ u oblasti zdravstva i to:
Izrada zakona i podzakonskih akata iz djelokruga Sektora;
Nadzor nad provođenjem županijskih zakona i propisa;
Organiziranje polaganja stručnih ispita zdravstvenih radnika;
Vršenje nadzora nad Zavodom zdravstvenog osiguranja i zdravstvenim ustanovama i privatnoj praksi koje se utemeljuju sukladno zakonu o Zdravstvenoj zaštiti;
Uređenje i vođenje zdravstvene politike i provođenje reforme iz oblasti zdravstva od interesa za područje županije;
Praćenje zdravstvenog stanja stanovništva i rada zdravstvenih ustanova na području županije, kao i staranje o provođenju utvrđenih prioriteta u zdravstvenoj zaštiti;
Donošenje strateškog plana zdravstvene zaštite za područje županije;
Stvaranje uvjeta za pristupačnost i ujednačenost korištenja primarne i sekundarne zdravstvene zaštite na području županije;
Uspostavljanje sustava poboljšanja kvaliteta i sigurnosti zdravstvene zaštite;
Provođenje epidemiološke, zdravstveno-statističke, socijalno-medicinske i zdravstveno - ekološke djelatnosti, te unapređenje zdravlja i prevenciju bolesti na području županije;
Provođenje mjera zaštite stanovništva od zaraznih bolesti iz svoje nadležnosti u skladu s propisima o zaštiti stanovništva od zaraznih bolesti;
Vršenje zdravstvenog, sanitarnog i farmaceutskog inspekcijskog nadzora;
Vršenje zdravstvenog, sanitarnog i farmaceutskog inspekcijskog nadzora;
Organizaciju i rad mrtvozorničke službe;
Suradnja s humanitarnim i stručnim organizacijama, savezima, komorama i udrugama na poslovima razvoja zdravstvene zaštite na svom području
Utvrđivanje prijedloga godišnjeg plana potrebnih specijalizacija i subspecijalizacija za županiju;
Praćenje rada županijskih komora iz oblasti zdravstva sa stanovišta provođenja zakona i utvrđene politike, te predlaže odgovarajuće mjere za unapređenje njihovog rada;
Rješavanje u prvom i drugom stupnju iz svoje nadležnosti;
Obavljanje i drugih poslova iz djelokruga rad Sektora, sukladno zakonu i drugim propisima donesenim temeljem zakona.